MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acinetobacter baumannii ACICU plasmid pACICU1

Total Repeats: 342

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010605	GA	3	6	377	382	50 %	0 %	50 %	0 %	184159989
2	NC_010605	ACTTAG	2	12	424	435	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	184159989
3	NC_010605	AAC	2	6	439	444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184159989
4	NC_010605	TTG	2	6	463	468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184159989
5	NC_010605	ATCA	2	8	534	541	50 %	25 %	0 %	25 %	184159989
6	NC_010605	CG	3	6	602	607	0 %	0 %	50 %	50 %	184159989
7	NC_010605	A	6	6	627	632	100 %	0 %	0 %	0 %	184159989
8	NC_010605	CTG	2	6	724	729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184159989
9	NC_010605	GAA	2	6	753	758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184159989
10	NC_010605	TAG	2	6	788	793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184159989
11	NC_010605	TAG	2	6	797	802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184159989
12	NC_010605	AGAA	2	8	885	892	75 %	0 %	25 %	0 %	184159989
13	NC_010605	AAAT	2	8	967	974	75 %	25 %	0 %	0 %	184159989
14	NC_010605	AGA	3	9	1054	1062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184159989
15	NC_010605	T	6	6	1105	1110	0 %	100 %	0 %	0 %	184159989
16	NC_010605	A	7	7	1274	1280	100 %	0 %	0 %	0 %	184159989
17	NC_010605	A	6	6	1348	1353	100 %	0 %	0 %	0 %	184159990
18	NC_010605	A	6	6	1478	1483	100 %	0 %	0 %	0 %	184159990
19	NC_010605	ATC	2	6	1488	1493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184159990
20	NC_010605	AAG	2	6	1499	1504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184159990
21	NC_010605	TGA	2	6	1506	1511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184159990
22	NC_010605	A	7	7	1518	1524	100 %	0 %	0 %	0 %	184159990
23	NC_010605	A	6	6	1552	1557	100 %	0 %	0 %	0 %	184159990
24	NC_010605	GAA	2	6	1570	1575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184159990
25	NC_010605	CAA	2	6	1585	1590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184159990
26	NC_010605	CAG	2	6	1640	1645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184159990
27	NC_010605	CAC	2	6	1646	1651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184159990
28	NC_010605	ACA	2	6	1696	1701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184159990
29	NC_010605	CAA	2	6	1702	1707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184159990
30	NC_010605	AAT	2	6	1726	1731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184159990
31	NC_010605	CACAA	2	10	1832	1841	60 %	0 %	0 %	40 %	184159990
32	NC_010605	A	6	6	1840	1845	100 %	0 %	0 %	0 %	184159990
33	NC_010605	CAT	2	6	2705	2710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184159991
34	NC_010605	GCTG	2	8	2771	2778	0 %	25 %	50 %	25 %	184159991
35	NC_010605	TC	3	6	2984	2989	0 %	50 %	0 %	50 %	184159991
36	NC_010605	CGT	2	6	2994	2999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184159991
37	NC_010605	CAA	2	6	3038	3043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184159991
38	NC_010605	GAA	2	6	3047	3052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184159991
39	NC_010605	TCA	2	6	3070	3075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184159991
40	NC_010605	CG	3	6	3102	3107	0 %	0 %	50 %	50 %	184159991
41	NC_010605	TGCTC	2	10	3110	3119	0 %	40 %	20 %	40 %	184159991
42	NC_010605	AAC	2	6	3174	3179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184159991
43	NC_010605	CCA	2	6	3259	3264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184159991
44	NC_010605	AGGCC	2	10	3299	3308	20 %	0 %	40 %	40 %	184159991
45	NC_010605	TAT	2	6	3318	3323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184159991
46	NC_010605	CTGA	2	8	3973	3980	25 %	25 %	25 %	25 %	184159992
47	NC_010605	CTG	2	6	4001	4006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184159992
48	NC_010605	TGT	2	6	4065	4070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184159992
49	NC_010605	CTGA	2	8	4072	4079	25 %	25 %	25 %	25 %	184159992
50	NC_010605	TTGGA	2	10	4102	4111	20 %	40 %	40 %	0 %	184159992
51	NC_010605	AGC	2	6	4122	4127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184159992
52	NC_010605	AAG	2	6	4165	4170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184159992
53	NC_010605	CTTT	2	8	4479	4486	0 %	75 %	0 %	25 %	184159993
54	NC_010605	T	6	6	4495	4500	0 %	100 %	0 %	0 %	184159993
55	NC_010605	T	8	8	4540	4547	0 %	100 %	0 %	0 %	184159993
56	NC_010605	TCC	2	6	4612	4617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184159993
57	NC_010605	TCAGA	2	10	4671	4680	40 %	20 %	20 %	20 %	184159993
58	NC_010605	TTG	2	6	4720	4725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184159993
59	NC_010605	TTC	2	6	4775	4780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184159993
60	NC_010605	TGT	2	6	4781	4786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184159993
61	NC_010605	TCA	2	6	4877	4882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184159993
62	NC_010605	TC	3	6	4901	4906	0 %	50 %	0 %	50 %	184159993
63	NC_010605	TGA	2	6	4911	4916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184159993
64	NC_010605	TGC	2	6	5027	5032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184159993
65	NC_010605	TAAT	2	8	5043	5050	50 %	50 %	0 %	0 %	184159993
66	NC_010605	CAT	2	6	5148	5153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184159993
67	NC_010605	AAG	2	6	5367	5372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184159993
68	NC_010605	TAA	2	6	5376	5381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184159993
69	NC_010605	ACT	2	6	5396	5401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184159993
70	NC_010605	ATTG	2	8	5848	5855	25 %	50 %	25 %	0 %	184159994
71	NC_010605	CAA	2	6	5883	5888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184159994
72	NC_010605	GCA	2	6	5903	5908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184159994
73	NC_010605	TGT	3	9	6079	6087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184159994
74	NC_010605	GTA	2	6	6149	6154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184159994
75	NC_010605	TC	3	6	6196	6201	0 %	50 %	0 %	50 %	184159994
76	NC_010605	AGCA	2	8	6297	6304	50 %	0 %	25 %	25 %	184159994
77	NC_010605	TCA	2	6	6344	6349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184159994
78	NC_010605	CTG	2	6	6384	6389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184159994
79	NC_010605	GTT	2	6	6401	6406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184159994
80	NC_010605	AAT	2	6	6413	6418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184159994
81	NC_010605	TCA	2	6	6515	6520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184159995
82	NC_010605	GAG	2	6	6532	6537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184159995
83	NC_010605	GAA	2	6	6678	6683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184159995
84	NC_010605	GAA	2	6	6691	6696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184159995
85	NC_010605	GATG	2	8	7064	7071	25 %	25 %	50 %	0 %	184159996
86	NC_010605	AG	3	6	7074	7079	50 %	0 %	50 %	0 %	184159996
87	NC_010605	ACT	2	6	7101	7106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184159996
88	NC_010605	CAA	2	6	7182	7187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184159996
89	NC_010605	ATT	2	6	7197	7202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184159996
90	NC_010605	CTC	2	6	7263	7268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184159996
91	NC_010605	AG	3	6	7310	7315	50 %	0 %	50 %	0 %	184159996
92	NC_010605	ATG	2	6	7553	7558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184159997
93	NC_010605	AAC	2	6	7560	7565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184159997
94	NC_010605	CAA	2	6	7582	7587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184159997
95	NC_010605	TGA	2	6	7633	7638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184159997
96	NC_010605	AGA	2	6	7658	7663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184159998
97	NC_010605	GAA	3	9	7712	7720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184159998
98	NC_010605	TGAT	2	8	7831	7838	25 %	50 %	25 %	0 %	184159998
99	NC_010605	GTT	2	6	7845	7850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184159998
100	NC_010605	ATG	2	6	7894	7899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184159998
101	NC_010605	AAT	2	6	8521	8526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184159999
102	NC_010605	CAT	2	6	8687	8692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184159999
103	NC_010605	GAG	2	6	8696	8701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184159999
104	NC_010605	GAAA	2	8	8716	8723	75 %	0 %	25 %	0 %	184159999
105	NC_010605	CAA	2	6	8756	8761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184159999
106	NC_010605	TAT	2	6	8779	8784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184159999
107	NC_010605	AACA	2	8	8849	8856	75 %	0 %	0 %	25 %	184159999
108	NC_010605	ACC	2	6	8858	8863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184159999
109	NC_010605	GAT	2	6	8891	8896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184159999
110	NC_010605	CTG	2	6	8916	8921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184159999
111	NC_010605	ATC	2	6	8922	8927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184159999
112	NC_010605	CAAA	2	8	8963	8970	75 %	0 %	0 %	25 %	184159999
113	NC_010605	TAT	2	6	8995	9000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184159999
114	NC_010605	TTG	2	6	9021	9026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184159999
115	NC_010605	AGCA	2	8	9078	9085	50 %	0 %	25 %	25 %	184159999
116	NC_010605	TCA	2	6	9118	9123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184159999
117	NC_010605	AGC	2	6	9175	9180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184159999
118	NC_010605	TTG	2	6	10170	10175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184160000
119	NC_010605	GACC	2	8	10199	10206	25 %	0 %	25 %	50 %	184160000
120	NC_010605	ATG	2	6	10406	10411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184160000
121	NC_010605	AGGA	2	8	10458	10465	50 %	0 %	50 %	0 %	184160000
122	NC_010605	AGG	2	6	10554	10559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184160000
123	NC_010605	GTC	2	6	10605	10610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184160000
124	NC_010605	CCA	2	6	10872	10877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184160001
125	NC_010605	TTA	2	6	10954	10959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184160001
126	NC_010605	TATTAA	2	12	10997	11008	50 %	50 %	0 %	0 %	184160001
127	NC_010605	TA	3	6	11033	11038	50 %	50 %	0 %	0 %	184160001
128	NC_010605	TCA	2	6	11137	11142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184160001
129	NC_010605	TGC	2	6	11193	11198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184160001
130	NC_010605	CTG	2	6	11213	11218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184160001
131	NC_010605	TAA	2	6	11331	11336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184160001
132	NC_010605	A	6	6	11345	11350	100 %	0 %	0 %	0 %	184160001
133	NC_010605	ATT	2	6	12022	12027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184160002
134	NC_010605	CAA	2	6	12140	12145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184160002
135	NC_010605	ACA	2	6	12160	12165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184160002
136	NC_010605	A	6	6	12180	12185	100 %	0 %	0 %	0 %	184160002
137	NC_010605	AGC	2	6	12244	12249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184160002
138	NC_010605	T	6	6	12253	12258	0 %	100 %	0 %	0 %	184160002
139	NC_010605	CA	3	6	12282	12287	50 %	0 %	0 %	50 %	184160002
140	NC_010605	AAT	2	6	12288	12293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184160002
141	NC_010605	AGCGA	2	10	12414	12423	40 %	0 %	40 %	20 %	184160003
142	NC_010605	CAT	2	6	12439	12444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184160003
143	NC_010605	GGAA	2	8	12467	12474	50 %	0 %	50 %	0 %	184160003
144	NC_010605	TAT	2	6	12531	12536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184160003
145	NC_010605	AAAC	2	8	12604	12611	75 %	0 %	0 %	25 %	184160003
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148	NC_010605	TAT	2	6	12747	12752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184160003
149	NC_010605	TTG	2	6	12773	12778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184160003
150	NC_010605	AGCA	2	8	12830	12837	50 %	0 %	25 %	25 %	184160003
151	NC_010605	TCA	2	6	12870	12875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184160003
152	NC_010605	AGC	2	6	12927	12932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184160003
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155	NC_010605	AGTTT	2	10	13404	13413	20 %	60 %	20 %	0 %	184160004
156	NC_010605	ATC	2	6	13497	13502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184160004
157	NC_010605	ATG	2	6	13561	13566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184160004
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159	NC_010605	T	7	7	13718	13724	0 %	100 %	0 %	0 %	184160004
160	NC_010605	CGT	2	6	13800	13805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184160004
161	NC_010605	AAG	2	6	13921	13926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184160004
162	NC_010605	CAA	2	6	13983	13988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184160004
163	NC_010605	TGT	2	6	13999	14004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184160004
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165	NC_010605	GTG	2	6	14115	14120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184160004
166	NC_010605	TGA	2	6	14153	14158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184160004
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169	NC_010605	TTG	2	6	14647	14652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184160005
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174	NC_010605	A	8	8	15345	15352	100 %	0 %	0 %	0 %	184160006
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176	NC_010605	ATG	2	6	15404	15409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184160006
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249	NC_010605	ATTTA	2	10	20732	20741	40 %	60 %	0 %	0 %	184160013
250	NC_010605	AGCA	2	8	20797	20804	50 %	0 %	25 %	25 %	184160013
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253	NC_010605	ATT	2	6	21040	21045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184160013
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259	NC_010605	CAA	2	6	21499	21504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184160013
260	NC_010605	ATG	2	6	21530	21535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184160013
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262	NC_010605	CAT	2	6	21645	21650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184160013
263	NC_010605	CGAAA	2	10	21697	21706	60 %	0 %	20 %	20 %	184160013
264	NC_010605	TG	3	6	21718	21723	0 %	50 %	50 %	0 %	184160013
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269	NC_010605	CAT	2	6	22065	22070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184160013
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.